Исмагиловская школа известна с 1831 года как медресе. Указным имамом и мугаллимом был назначен Абдулгалим Абдулнасыров. В 1905 году открылось земское училище, было 2 медресе. Здесь давали уроки мулла Имаметдин Тимербаев и светские учителя Яппар и Тахветдин. В 1919 году функционировали две советские трудовые школы 1 ступени. В 1924 году открылась первая 4-х летняя советская школа, расположенная в 2-х небольших зданиях у озера «Торна куагы». В 1938 году школа стала семилетней. Здание мечети и медресе стали школьными. Организатором школы был Сайфуллин из г.Стерлитамака. В 1959 году школа стала восьмилетней. Было построено новое здание, заложен пришкольный участок. В 1971 году был построено новое типовое здание. В 1973 году Исмагиловская школа стала средней. В 1997 году к основному зданию школы был построен пристрой, где разместились интернат, столовая, актовый зал, учебные кабинеты.